Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mfsd4aQ6PDC8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms