Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trak1Q6PD31 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms