Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HltfQ6PCN7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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