Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms