Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms