Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kdm2bQ6P1G2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm2bQ6P1G2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms