Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rcbtb1Q6NXM2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms