Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd2Q6NXI6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms