Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms