Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HelbQ6NVF4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms