Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr44Q6NVE8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr44Q6NVE8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms