Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp140Q6NSQ5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp140Q6NSQ5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms