Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcd11Q6NS46 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms