Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l2Q6KAU8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms