Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt72Q6IME9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms