Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms