Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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