Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hecw2Q6I6G8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms