Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg9bQ6EBV9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms