Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Smarca2Q6DIC0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms