Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nop58Q6DFW4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms