Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rftn1Q6A0D4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms