Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cep290Q6A078 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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