Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms