Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top2bQ64511 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Top2bQ64511 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms