Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms