Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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ScxQ64124 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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ScxQ64124 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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ScxQ64124 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ScxQ64124 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms