Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Defa17Q64016 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa17Q64016 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Defa17Q64016 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Defa17Q64016 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa17Q64016 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms