Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms