Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20917Q62457 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms