Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CcncQ62447 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms