Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vamp1Q62442 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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