Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtmQ62388 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtmQ62388 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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