Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sprr1bQ62267 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms