Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Kdm5dQ62240 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
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