Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six3Q62233 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six3Q62233 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six3Q62233 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Six3Q62233 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Six3Q62233 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Six3Q62233 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six3Q62233 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms