Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema3bQ62177 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3bQ62177 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms