Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh1a2Q62148 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms