Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3bQ62141 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms