Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprrQ62132 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprrQ62132 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms