Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phox2aQ62066 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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