Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd47Q61735 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd47Q61735 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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