Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd53Q61451 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms