Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsx2Q61412 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsx2Q61412 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms