Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tfap2bQ61313 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2bQ61313 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2bQ61313 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2bQ61313 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2bQ61313 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2bQ61313 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2bQ61313 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2bQ61313 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tfap2bQ61313 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms