Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamb3Q61087 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms