Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxd3Q61060 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Foxd3Q61060 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Foxd3Q61060 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd3Q61060 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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