Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift20Q61025 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms