Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Klf3Q60980 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms