Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp7Q60973 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms